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dc.contributor.authorGoya Jorge, Addel Arnaldo
dc.contributor.authorGalpert Cañizares, Deborah
dc.contributor.authorMillo Sánchez, Reinier
dc.contributor.authorCompanioni Brito, Claudia
dc.coverage.spatialLa Habanaen_US
dc.date.accessioned2018-12-07T15:30:27Z
dc.date.available2018-12-07T15:30:27Z
dc.date.issued2016-07-01
dc.identifier.citationCitar según la fuente original, 2010. Matlab [Online]. Available: http://www.mathworks.com Accessed 2012. ALTSCHUL, S. F., MADDEN, T. L., SCHAFFER, A. A., ZHANG, J., ZHANG, Z., MILLER, W. & LIPMAN, D. J. 1997. Gapped BLAST and PSI-BLAST: A new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Research, 25, 3389-3402. [ Links ] BONVIN, N. 2012. Linear Scalability of Distributed Applications. ÉCOLE POLYTECHNIQUE FÉDÉRALE DE LAUSANNE. [ Links ] BRASSARD, G., BRATLEY, T. (ed.) 1997. Fundamentos de Algoritmia, Madrid: Prentice Hall. [ Links ] FITCH, W. M. 1970. Distinguishing Homologous from Analogous Proteins. Systematic Zoology Syst Biol, 19, 99-113. [ Links ] GALPERT, D., RÍO, S. D., HERRERA, F., ANCEDE-GALLARDO, E., ANTUNES, A. & AGÜERO-CHAPIN, G. 2015. An Effective Big Data Supervised Imbalanced Classification Approach for Ortholog Detection in Related Yeast Species. BioMed Research International [Online], 2015, Article ID 748681. [ Links ] GRAMA, A., GUPTA, A., KARYPIS, G. & KUMAR, V. (eds.) 2003. Introduction to Parallel Computing, Second Edition: Addison Wesley. [ Links ] KAMVYSSELIS, M. K. 2003. Computational comparative genomics: genes, regulation, evolution. Doctor of Philosophy in Computer Science, Massachusetts Institute of Technology [ Links ] KRISTENSEN, D. M., WOLF, Y. I., MUSHEGIAN, A. R. & KOONIN, E. V. 2011. Computational methods for Gene Orthology inference. Briefings in bioinformatics, 12, 379-391. [ Links ] KUZNIAR, A., HAM, R. C. H. J. V., PONGOR, S. & LEUNISSEN, J. A. M. 2008. The quest for orthologs: finding the corresponding gene across genomes. Trends in Genetics, 30, 1-13. [ Links ] SALICHOS, L. & ROKAS, A. 2011. Evaluating Ortholog Prediction Algorithms in a Yeast Model Clade. PLoS ONE, 6, 1-11. [ Links ] SONNHAMMER, E. L. L., GABALDÓN, T., SILVA, A. W. S. D., MARTIN, M., ROBINSON-RECHAVI, M., BOECKMANN, B., THOMAS, P. D. & DESSIMOZ, C. 2014. Big data and other challenges in the quest for orthologs. Bioinformatics Editorial, 1-6. [ Links ]en_US
dc.identifier.issn2227- 1899en_US
dc.identifier.urihttp://dspace.uclv.edu.cu:8089/handle/123456789/10465
dc.description.abstractEl presente trabajo analiza la escalabilidad de una implementación paralela del cálculo de medidas de similitud entre pares en la detección de genes ortólogos. El análisis se realiza mediante el uso de métricas de calidad como la aceleración y la eficiencia que se calculan para algoritmos de cálculo del alineamiento par a par de secuencias y de cálculo de la similitud del perfil físico-químico de las proteínas. Los experimentos realizados en un conjunto de datos de dos genomas arrojan una mejora en el tiempo de ejecución de las implementaciones paralelas. No obstante, la escalabilidad de los algoritmos continúa siendo un objetivo de nuevas implementaciones.en_US
dc.language.isoesen_US
dc.rightsEste documento es Propiedad Patrimonial de Ediciones Futuro y se socializa en este Repositorio gracias a la política de acceso abierto de la revista Revista Cubana de Ciencias Informáticas.en_US
dc.subjectMedidas de Similituden_US
dc.subjectProgramación Paralelaen_US
dc.subjectComplejidad Temporalen_US
dc.subjectEscalabilidaden_US
dc.subjectSimilarity Measuresen_US
dc.subjectParallel Computingen_US
dc.subjectTime Complexityen_US
dc.subjectScalabilityen_US
dc.subject.otherMedidas de Similituden_US
dc.subject.otherProgramación Paralelaen_US
dc.subject.otherComplejidad Temporalen_US
dc.subject.otherEscalabilidaden_US
dc.titleAnálisis de la escalabilidad del cálculo paralelo de medidas de similitud entre pares de genesen_US
dc.typeArticleen_US
dc.rights.holderUniversidad de las Ciencias Informáticasen_US
dc.relation.journalRevista Cubana de Ciencias Informáticasen_US
dc.contributor.departmentUniversidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Matemática, Física y Computación. Departamento de Computaciónen_US
dc.type.article1en_US
dc.source.volume10en_US
dc.source.issue3en_US
dc.source.initialpage71en_US
dc.source.endpage84en_US


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