Desarrollo de un sistema de modelación semiautomatizado para la predicción de la biodisponibilidad oral de fármacos, en humanos

Abstract

La predicción in-silico de la biodisponibilidad oral humana es una herramienta relevante para la selección de potenciales candidatos a fármacos y para el rechazo de aquellas moléculas con menor probabilidad de éxito durante las primeras etapas del descubrimiento y desarrollo de fármacos. Sin embargo, la alta variabilidad y complejidad de la biodisponibilidad oral, junto con el uso de bases de datos pequeñas y no muy diversas, el uso de técnicas estadísticas aplicadas de forma individual y la falta de proyección a la automatización del proceso de modelación, han limitado el desarrollo de modelos in-silico fiables y aplicables para la predicción de esta propiedad a partir de la estructura química. Este estudio presenta el primer flujo continuo de modelación aplicado a la biodisponibilidad oral humana, implementado completamente en la Plataforma Analítica KNIME. A partir de una base de datos de 1483 fármacos y moléculas afines se desarrollaron dos métodos de ensamble para la combinación de cinco algoritmos de clasificación. Los resultados de los modelos ensamblados fueron sustancialmente mejores que los de los modelos individuales, obteniéndose una capacidad predictiva superior al 76%. Se incluyó, dentro del flujo de modelación desarrollado, una sección para la predicción de nuevas moléculas de forma rápida y semiautomatizada, validándose la misma con una serie externa de 27 fármacos y alcanzándose una exactitud superior a 80%. El sistema de modelación desarrollado estará disponible gratuitamente online, y en constante actualización