Procedimiento de extracción de rasgos 3D-proteicos basado en Álgebra Lineal: Aplicaciones en estudios bioinformáticos

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dc.contributor.advisorMarrero Ponce, Yovani
dc.contributor.advisorGarcía Jacas, César Raúl
dc.contributor.advisorAndrea Sampe, Ortega
dc.contributor.authorContreras Torres, Ernesto
dc.coverage.spatialSanta Claraen_US
dc.date.accessioned2019-03-11T23:42:45Z
dc.date.available2019-03-11T23:42:45Z
dc.date.issued2016
dc.description.abstractEn el presente trabajo, se propone un nuevo procedimiento para la extracción de rasgos tridimensionales (3D) proteicos basado en las formas algebraicas 2-lineales utilizando la kth matriz multi-métrica bidimensional de similitud-disimilitud para codificar información relativa a las interacciones no covalentes de estos biopolímeros. Se proponen además esquemas de generalización para el cálculo de las distancias inter-atómicas mediante el empleo de varias métricas. Se usaron las matrices simple-estocástica y de probabilidad mutua para normalizar la matriz multi-métrica bidimensional de similitud-disimilitud no estocástica. Asimismo, se generaliza la obtención de índices totales y locales por medio de varios operadores de agregación. Con el objetivo de discriminar entre las diferentes interacciones no covalentes entre las cadenas laterales de los aminoácidos, se definen procedimientos de cortes macromoleculares geométricos y topológicos. Además, se desarrolló un software denominado ToMoCoMD-CAMPS MuLiMs-MCoMPAs que automatiza el cálculo de los descriptores propuestos. Se realizaron estudios de variabilidad basado en entropía de Shannon y análisis de componentes principales. Adicionalmente, se creó una métrica denominada Entropía Promedio de Shannon Estandarizada y una nueva representación gráfica, de utilidad en los análisis de variabilidad. Además, los descriptores propuestos se aplicaron satisfactoriamente en la clasificación estructural de proteínas, así como en la predicción de la velocidad de plegamiento de cadenas polipeptídicas. En ambos estudios se obtuvieron modelos robustos y de buena capacidad predictiva. Finalmente, se anticipa la potencial aplicación de los descriptores propuestos en la modelación de otras propiedades biológicas y/o funciones de interés en ciencia de proteínas.en_US
dc.description.sponsorshipFacultad de Matemática, Física y Computación. Departamento de Computación .en_US
dc.description.statusnon-publisheden_US
dc.identifier.urihttps://dspace.uclv.edu.cu/handle/123456789/10874
dc.language.isoesen_US
dc.publisherUniversidad Central “Marta Abreu” de Las Villasen_US
dc.rightsEste documento es Propiedad Patrimonial de la Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Los usuarios podrán hacer uso de esta obra bajo la siguiente licencia: Creative Commons: Atribución-No Comercial-Compartir Igual 4.0 Licenseen_US
dc.subjectDescriptor 3D Proteicoen_US
dc.subjectFormas Algebraicasen_US
dc.subjectMatriz Milimétrica de Similitud Disimilituden_US
dc.subjectMétricasen_US
dc.subjectOperadores de Agregaciónen_US
dc.subject.otherDescriptores Molecularesen_US
dc.subject.otherProteínasen_US
dc.subject.otherDesarrollo de Softwareen_US
dc.subject.otherBioinformáticaen_US
dc.titleProcedimiento de extracción de rasgos 3D-proteicos basado en Álgebra Lineal: Aplicaciones en estudios bioinformáticosen_US
dc.typeThesisen_US
dc.type.thesismasteren_US

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