Identificación de secuencias que se expresan diferencialmente en la interacción no compatible Musa acuminata (AA) genotipo 'Calcutta 4'- Mycosphaerella fijiensis Morelet

Abstract

La enfermedad de la Sigatoka negra producida por el hongo Mycosphaerella fijiensis Morelet (teleomorfo) (Pseudocercospora fijiensis (Morelet) Deighton, anamorfo), se considera la enfermedad foliar mas destructiva y costosa a nivel mundial que afecta la producción de bananos y plátanos. El estudio de los genes involucrados en la respuesta de defensa en la planta ante el ataque de patógenos, constituye un paso importante para la elucidación de los mecanismos moleculares de resistencia a enfermedades. En este trabajo se obtuvo una biblioteca sustractiva de ácido desoxirribonucleico complementaria que contiene secuencias expresadas diferencialmente en el genotipo resistente 'Calcutta 4' ante la infección con M. fijiensis (6 a 12 días posteriores a la inoculación), la cual consta de un total de 600 clones recombinantes, con longitud de inserto entre 100 y 1 400 pares de bases (pb) y una longitud promedio de 537 pb. Como resultado del ensamblaje con la herramienta bioinformática CAP3, de 97 secuencias de la biblioteca sustractiva fueron obtenidas 63 secuencias blanco expresadas, que incluían 42 secuencias aisladas y 21 ensamblajes. La identificación de las mismas según su homología con secuencias anotadas en la base de datos para proteínas no redundante (GenBank), permitió agruparlas en: destino de proteínas (1,6%), estrés oxidativo (4,8%), metabolismo (6,3%), producción de energía (6,3%), función desconocida (38,1%) y sin homología (42,8%).