Análisis comparativo de secuencias genómicas mediante la aplicación de la transformada de fourier sobre campos finitos
| dc.contributor.advisor | Sánchez Rodríguez, Robersy | |
| dc.contributor.advisor | Grau Ábalo, Ricardo del Corazón | |
| dc.contributor.author | Silveira Díaz, Pavel | |
| dc.coverage.spatial | Santa Clara | en_US |
| dc.date.accessioned | 2018-05-17T15:26:38Z | |
| dc.date.available | 2018-05-17T15:26:38Z | |
| dc.date.issued | 2008-07-10 | |
| dc.description.abstract | In this research a new tool for the comparative genomic sequence analysis is developed. The application of the Fourier's transform over finite fields (MFT) allows a recodification in Zp of the DNA genomic sequences represented in Z5. The method is based on the comparison of the power spectra of the recodified sequences by means of the use of the nonparametric bifactorial ANOVA for the detection of the statistically significant differences between the spectral peaks induced by the MFT. There appears the usefulness of the method application in the phylogenetic analysis of the aligned DNA sequences, in the direct and indirect comparison of the power spectra. The indirect comparisons of the DNA sequences make possible the incorporation, in the analysis, of random sequences generated with different distributions of nitrogenous bases. The application of this tool allows, even, the detection of the existence of statistically significant differences in the organizational architectures of genomic sequences of phylogenetically close species. | en_US |
| dc.description.abstract | En esta investigación se desarrolla una nueva herramienta para análisis comparativo de secuencias genómicas. La aplicación de la transformada de Fourier sobre campos finitos (MFT) permite una recodificación en Zp de las secuencias de ADN genómico representadas en Z5. El método se basa en la comparación de los espectros de potencia de las secuencias recodificadas mediante el uso del ANOVA bifactorial no-paramétrico para la detección de diferencias estadísticamente significativas entre los picos espectrales inducidos por la MFT. Se muestra la utilidad de la aplicación del método en el análisis filogenético de las secuencias de ADN alineadas, en la comparación directa e indirecta de los espectros de potencia. Las comparaciones indirectas de las secuencias de ADN posibilitan la inclusión, en el análisis, de secuencias aleatorias generadas con diferentes distribuciones de bases nitrogenadas. La aplicación de esta herramienta permite, incluso, la detección de la existencia de diferencias estadísticamente significativas en las arquitecturas organizativas de secuencias genómicas de especies filogenéticamente cercanas. | en_US |
| dc.description.sponsorship | Facultad de Matemática, Física y Computación. Departamento de Ciencias de la Computación | en_US |
| dc.description.status | non-published | en_US |
| dc.identifier.uri | https://dspace.uclv.edu.cu/handle/123456789/9382 | |
| dc.language.iso | es | en_US |
| dc.publisher | Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas | en_US |
| dc.rights | Este documento es Propiedad Patrimonial de la Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Los usuarios podrán hacer uso de esta obra bajo la siguiente licencia: Creative Commons: Atribución-No Comercial-Compartir Igual 4.0 License | en_US |
| dc.subject | Análisis Comparativo | en_US |
| dc.subject | Secuencias Genómicas | en_US |
| dc.subject | Transformada de Fourier | en_US |
| dc.subject | Campos Finitos | en_US |
| dc.subject | Bioinformática | en_US |
| dc.subject.other | Análisis Comparativo | en_US |
| dc.subject.other | Secuencias de ADN | en_US |
| dc.subject.other | Transformada de Fourier | en_US |
| dc.subject.other | Algoritmos | en_US |
| dc.subject.other | Diseño e Implementación | en_US |
| dc.subject.other | Bioinformática | en_US |
| dc.title | Análisis comparativo de secuencias genómicas mediante la aplicación de la transformada de fourier sobre campos finitos | en_US |
| dc.type | Thesis | en_US |
| dc.type.thesis | bachelor | en_US |