Base de datos y aplicación Web para la consulta de la relación de ortología entre dos especies.

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dc.contributor.advisorGalpert Cañizares, Deborah Raquel
dc.contributor.authorRojas Peñate, Landy
dc.coverage.spatialSanta Claraen_US
dc.date.accessioned2018-03-24T18:28:00Z
dc.date.available2018-03-24T18:28:00Z
dc.date.issued2011-07-02
dc.description.abstractLa variedad de formatos en la presentación de resultados de ortología de las bases de datos disponibles en la Web requiere de soluciones integradoras que faciliten la consulta de la información y faciliten la comparación de los algoritmos de detección de ortólogos en cuanto a su precisión. Además, el conocimiento almacenado en las distintas bases de datos puede servir de fundamento para nuevos y más precisos algoritmos de predicción de genes ortólogos. Debido a esto, proponemos técnicas de combinación de agrupamientos para obtener agrupamientos de consenso más precisos a partir de la consulta de la diversidad. La aplicación que se presenta en este trabajo pretende agrupar resultados de algoritmos en un repositorio actualizable a través de archivos OrthoXML. La base de datos fue poblada con datos de los genomas S.Cerevisiae y S.Pombe procesados por algoritmos propios para los formatos de INPARANOID 7.0, Sanger versión 2.0 y KOG. Además, esta aplicación implementa medidas externas de calidad de agrupamientos aplicables a los agrupamientos en el repositorio y a sus combinaciones.en_US
dc.description.abstractThe variety of the formats in the ortology databases available in Internet requires the emergence of some integration solutions to facilitate the queries of these data sources and the comparison of the precision of the corresponding ortholog detection algorithms. The knowledge stored in these resources should be useful for the development of more accurate otholog detection algorithms. That is why; we propose the use of some ensemble techniques to obtain consensus clustering through the diversity study. The Web application we propose in this project is connected to a new repository updatable through OrthoXML files and web services. The database was filled with data from S.Cerevisiae and S.Pombe genomes processed by appropriate algorithms for the INPARANOID 7.0’s, Sanger version 2.0’s and KOG’s formats. Furthermore, the application implements some clustering quality measures to be applied to the algorithm results in the repository and their ensembles.en_US
dc.description.sponsorshipFacultad de Matemática, Física y Computación. Departamento de Ciencias de la Computaciónen_US
dc.description.statusnon-publisheden_US
dc.identifier.urihttps://dspace.uclv.edu.cu/handle/123456789/9087
dc.language.isoesen_US
dc.publisherUniversidad Central “Marta Abreu” de Las Villasen_US
dc.rightsEste documento es Propiedad Patrimonial de la Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Los usuarios podrán hacer uso de esta obra bajo la siguiente licencia: Creative Commons: Atribución-No Comercial-Compartir Igual 4.0 Licenseen_US
dc.subjectBase de Datosen_US
dc.subjectAplicación Weben_US
dc.subjectConsulta de la Informaciónen_US
dc.subjectRelación de Ortologíaen_US
dc.subjectEspeciesen_US
dc.subjectGrupo de Bioinformáticaen_US
dc.subjectUniversidad Central Marta Abreu de Las Villas (UCLV)en_US
dc.subject.otherBase de Datosen_US
dc.subject.otherDi/señoen_US
dc.subject.otherAplicación Weben_US
dc.subject.otherAlgoritmosen_US
dc.subject.otherTécnicas de Agrupamientoen_US
dc.subject.otherMétodos de Detecciónen_US
dc.subject.otherOrtologíaen_US
dc.subject.otherDesarrollo de Aplicacionesen_US
dc.subject.otherBioinformáticaen_US
dc.subject.otherUniversidad Central Marta Abreu de Las Villasen_US
dc.titleBase de datos y aplicación Web para la consulta de la relación de ortología entre dos especies.en_US
dc.typeThesisen_US
dc.type.thesisbacheloren_US

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